En 1982 se creó el Colegio Oficial de Biólogos, por la Ley 2/1974, de 13 de febrero.

Este Colegio se organizó en Delegaciones, como unidades operativas en diferentes Comunidades Autónomas, sin autonomía legal. A raíz de la aprobación sus Estatutos definitivos, en 1996 (Real Decreto 693/1996, de 26 de abril), se inicia el proceso de segregación de estas Delegaciones, que pasan a convertirse en Colegios Territoriales, con carácter independiente, sujetos a la normativa de Colegios Profesionales de sus propias Comunidades Autónomas. La primera Delegación en tomar el camino de la segregación fue la de Euskadi, pasando a convertirse en el Colegio Oficial de Biólogos de Euskadi, constituido por el Decreto 167/1997, de 8 de julio del Departamento de Justicia, Economía Trabajo y Seguridad Social del Gobierno Vasco.

Desde esa fecha, el COBE viene desarrollando sus funciones como órgano de representación de los Biólogos de la CAPV.